文件名称:matlab代码影响-fMRI-Quality-Checker:Matlab和SPM12脚本可为fMRI数据计算各种图像和时间序列质量指标
文件大小:546KB
文件格式:ZIP
更新时间:2024-06-11 01:06:48
系统开源
matlab代码影响功能磁共振成像质量检查器 一组Matlab和SPM12脚本,用于为fMRI数据集计算多个质量指标和可视化效果。 受PCP-QAP和MRIQC的影响。 注意:此工具正在持续开发中,尚未经过充分测试 使用SPM12和Matlab为fMRI时间序列计算多种质量控制措施的功能。 目标是创建一个工具,供熟悉SPM12和Matlab的fMRI技术人员/研究人员/临床医生使用,该工具可以计算有助于诊断fMRI数据质量问题的度量。 它不打算用作质量诊断的基础,因为已知这些措施是相对的,并且会根据扫描仪的位置,采集时间,数据格式等而有所不同。 但是,它可以提供对源自扫描仪或单个主题的可能的数据质量问题的见解。 功能步骤包括预处理获取的功能磁共振成像和结构数据(将结构图像共同注册为第一功能图像,将共同注册的结构图像分割为组织类型,以及将这些片段重新划分为功能分辨率图像网格),以及为一组标准的QC措施调用功能基于各种来源(主要包括来自预处理过的Connectomes项目(PCP)和MRIQC的质量评估协议(QAP))。此功能使用SPM12功能和批处理例程。如果未明确设置SPM12批处理参
【文件预览】:
fMRI-Quality-Checker-master
----calculateQCmeasures.m(11KB)
----calculateFD.m(1KB)
----example_html_output.html(1KB)
----mask_contour.png(71KB)
----mean_epi.png(67KB)
----LICENSE(34KB)
----displayMaskContour.m(2KB)
----standardPreproc.m(8KB)
----createMontage.m(2KB)
----README.md(3KB)
----detrend4D.m(1KB)
----timeseries_summary.png(189KB)
----tsnr_brain.png(63KB)
----tsnr_whole.png(95KB)
----stddev_epi.png(62KB)