higlass:Web的快速大规模矩阵可视化

时间:2024-05-20 14:22:10
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文件名称:higlass:Web的快速大规模矩阵可视化

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更新时间:2024-05-20 14:22:10

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介绍 HiGlass是基于Web的查看器,可处理太大而无法一次查看的数据集。 它具有多个视图的同步导航以及连续的缩放和平移功能,可在基因组位点和分辨率之间进行导航。 它支持对来自不同实验条件的基因组(例如Hi-C,ChIP-seq或床注释)和其他数据(例如地理图,十亿像素图像或抽象的1D和2D顺序数据)进行视觉比较,并可用于有效地识别实验性干扰的显著结果,产生新的假设并与社区分享结果。 可以在上找到活动实例。 可用于在本地运行实例,尽管我们建议使用软件包启动,停止和配置本地实例。 有关如何使用和安装HiGlass的文档,请访问 。 引文 Kerpedjiev,P.,Abdennur,N.,Lekschas,F.,McCallum,C.,Dinkla,K.,Strobelt,H ...,&Gehlenborg, N.HiGlass:基于Web的视觉探索和基因组相互作用分析地图。 基因组生


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