GenomeAnalysis:基因组分析课程2021 UU

时间:2024-05-10 17:08:49
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文件名称:GenomeAnalysis:基因组分析课程2021 UU

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更新时间:2024-05-10 17:08:49

Shell

基因组分析 该存储库包含“基因组分析”课程(2021年Spring)项目的代码和讨论。 该项目再现了Christel等人在随后的论文中所做的分析; 多组学揭示了嗜酸性,氧化矿物质的模式物种钩端螺旋体的生活方式,可在找到 有关该项目的更多信息,请参见Wiki。 联系人:


【文件预览】:
GenomeAnalysis-main
----imagesAndpdfs()
--------DataStructureOfRep.jpg(89KB)
--------image001.jpg(83KB)
--------genomeAssemblyQC_Qustreport.pdf(39KB)
--------lferriphilum_MUMmerPlot.png(9KB)
----README.md(499B)
----Code()
--------0103_assemblyQC_MUMmer.sh(2KB)
--------02_RawReads_QualityControl_FastaQC.sh(535B)
--------0102_assemblyQC_quast.sh(1KB)
--------0202trimmomatic.sh(732B)
--------0203_assemblyQC_MUMmer.sh(478B)
--------0301AnnotationProkka.sh(579B)
--------0301AnnotationeggNOG.txt(652B)
--------01_assembly_canu.sh(865B)
----folders_structure.txt(0B)
----image()
--------DataStructureOfRep.jpg(89KB)
--------image001.jpg(83KB)
----Paper3.pdf(2.47MB)

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