【文件属性】：
文件名称：clipper:识别CLIP-seq峰的工具
文件大小：164.86MB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-05-09 14:21:41
Python
CLIPper-CLIP峰富集识别
一种检测CLIP-seq峰的工具。
请访问我们的Wiki页面以了解有关Clipper用法的更多信息： :
安装
# recreate PYTHON3 conda environment
cd clipper
conda env create -f environment3.yml
conda activate clipper3
pip install .
替代安装
感谢@rekado使Clipper在GNU Guix上可用guix install clipper
我们注意到某些平台上的安装可能会失败。 Dockerized的clipper在的eclip存储库中。
命令行用法
# shows all the options
clipper -h
# minimal command
clipper -b YOUR_BAM_FILE.bam -o YO