ancestral-alleles:基因组变异的祖先等位基因推断

【文件属性】：
文件名称：ancestral-alleles:基因组变异的祖先等位基因推断
文件大小：30KB
文件格式：ZIP
更新时间：2021-06-17 09:50:31
Perl 祖先等位基因 该软件旨在使用全基因组多重比对推断祖先等位基因 (AA)。 用法 perl run_aa.pl --emf EMF_DIR --input INPUT.txt --output OUTPUT.txt 这将遍历 INPUT.txt 文件中的所有变体并计算每个变体的 AA。 目前只支持特定的 TSV 文件格式，但新的文件格式（尤其是 VCF 将在不久的将来支持）。 依赖关系 Ortheus： : ，虽然推荐使用 肌肉： : 学分 自之前的版本以来，已经发生了很多变化，但这很大程度上受到了 Kathryn Beal 在欧洲生物信息学研究所 ( ) 期间所做工作的启发。 这是在 Paul Flicek 小组的 Javier Herrero 的监督下完成的。 原始文件可以在 Ensembl Compara 存储库中找到，位于 modules/Bio/EnsEMBL/Co

【文件预览】：
ancestral-alleles-master
----BaseAncestralAlleles.pm(54KB)
----run_aa.pl(16KB)
----index_emf_files.pl(4KB)
----RunAncestralAllelesOnEMF.pm(20KB)
----LICENSE(613B)
----README.md(1KB)
----test.pl(28KB)
----scripts()
--------fix_1kg_vcf.pl(9KB)